苗木病虫害不仅可以使用药物和人工防治，巧妙的使用化肥也能起到很好的防治效果。利用化肥防治农林花卉作物病虫害，不仅能减少因农药使用不当而造成的药害，还能有效地促进作物的生长，是安全、经济、有效的好方法。
1、可以利用尿素、碳酸氢铵、氨水进行杀虫。这三种氨素化肥都具有较强的挥发性，对害虫有刺激、腐蚀和熏蒸作用。尤其对红蜘蛛、叶螨、蚜虫、蓟马等一些体形小、耐力弱的害虫，防治效果尤佳。如用2%的尿素溶液或1%的碳酸氢铵溶液或O.5%的氨水溶液，在花卉害虫发生时根外喷施，每7天左右喷1次，连喷2至3次，防虫效果好。每亩苗圃用15至25公斤碳酸氢铵与农家肥混合施入垄底，能使蛴螬等地下害虫的危害率降低80%以上。草本花卉每亩追施碳酸氢铵20公斤，也可大大减轻小地老虎等地下害虫的危害。氨水还能杀死蜗牛、蛞蝓等害虫。
2、磷肥可以杀虫和灭菌。用2%的过磷酸钙液喷洒棉花，可赶走产卵的棉铃虫，并能杀死棉花红蜘蛛、蛞蝓等害虫。用1%的过磷酸钙喷洒番茄，对预防脐腐病也有明显效果。
3、硅肥可以抗虫害。对农林花卉作物施肥时拌入硅钙肥，作物吸收后硅元素会聚集在作物的表皮细胞中，形成非常坚硬的表皮层，使害虫很难侵害，从而增强了对害虫的抵抗力。尤其在草本花卉上施用硅钙肥，抗虫效果更好。
4、可用草木灰液杀虫。用10公斤草木灰兑水50公斤，浸泡24小时后，取其过滤液喷施，可有效地防治果树、农作物和花卉上的蚜虫，草木灰中的钾素还能增强作物抗倒伏能力，增强果树和花卉的抗风能力。如在草木灰液中加入适量敌百虫，会增加药剂的触杀、熏蒸作用，提高对蚜虫、红蜘蛛等害虫的杀伤效果。此外，用500倍的磷酸二氢钾喷洒番茄植株，可以防治花叶病毒。用O.2%的硼酸溶液喷洒黄瓜，可以防治黄瓜霜霉病。