灰霉病、锈病和斑枯病并称为菊花三大病害，在菊花栽培生产中最为常见。发病严重时可引起大量落叶，影响植株开花，大大降低菊花的观赏价值和经济价值。因此掌握菊花三大病害的防治是一名园艺工作者必须掌握的一门技术。
菊花灰霉病的症状：主要危害菊花的叶、茎、花等部位。叶受害时在叶片边缘呈褐色病斑，表面略呈轮纹状波皱，叶柄和花柄先软化，然后外皮腐烂。花受害时影响种子成熟。高温多雨，氮肥施用过多，栽植过密，土壤质地粘重等都有利于病害的发生。
防治方法：一是客土栽植。病菌主要在土壤中越冬，因此，无论是园栽还是盆栽，一律要求土壤是无病新土；二是发现病叶病株及时清除，集中深埋或烧毁，以防病害传播；三是定植前可用65%代森锌300倍液浸根10～15分钟；四是重视培育，注意改善通风透光条件，不偏施氮肥，严防土壤渍水；五是在发病初期可喷洒波美0.3～0.5度的石硫合剂，或代森锌、多菌灵杀菌剂。
菊花锈病的症状：主要危害菊花的叶和茎，以叶受害为重。初在叶片上现浅黄色小斑，病叶背对应处也生出小褐绿斑。后产生稍隆起的疱状物，疱状物破裂后，散出大量黄褐色粉状物。颜色由淡渴色逐渐变成黄褐色，严重时常造成全株叶片死亡。栽培管理不善，通风透光不良，土壤缺肥或氮肥过量，土壤渍水，空气湿度过大，都有利于该病的大发生。该病4～10月均可流行危害。
防治方法：一是合理施肥。在配合施肥的基础上，适当增施磷钾肥以提高植株的抗菌力；二是盆栽菊花，应经常将排水孔洞疏通，严防盆内渍水；三是生态防病。保护地栽培菊花要注意通风透光，升温降湿，延迟叶片结露时间；四是药剂防治。发病季节可喷65%代森锌500倍液，或0.3～0.5波美度的石硫合剂，可有效地控制该病流行。
菊花斑枯病的症状：主要危害菊花的叶片。最初下部叶片上出现褐色小斑点，而后逐渐扩大，边缘呈黑褐色，后扩展成黑褐色圆形或近圆形不规则形斑，大小约5～10毫米，外部有一不明显的黄色晕圈。后期病斑边缘呈黑褐色，中央稍褪色，湿度大时出现不大明显的小黑点。病重时几种病斑连在一起，使全叶焦黑脱落，连作种植发病严重。
防治方法：一是合理换茬种植，选用无病植株嫁接；二是注意开沟排水，降低土壤湿度；三是经常整枝，消除病残体，改善通风透光条件。实施化控技术，促植株生长健壮，增强抗病耐病性；四是药剂防治。发病初期，可用30%碱式硫酸铜悬浮液400倍液，或80%敌菌丹可湿性粉剂500倍液，或50%甲基硫菌灵悬浮剂800倍或75%苯菌灵1500倍液防治。
